Za okupace v letech 1938-1945 žilo v Ústí nad Labem přibližně
dva tisíce Čechů s tzv. občanstvím Protektorátu Čechy a Morava.
Češi za války měli s ostatními obyvateli nerovnoprávné postavení.
Na podzim 1938 bylo zrušeno české školství. České děti mohly navštěvovat
pouze německé obecné a měšťanské školy, případně se vyučit řemeslu.
Výjimkou bylo několik českých studentů německých středních škol,
kteří byli přijati ještě před 9. říjnem 1938. Tito studenti mohli
školy dokončit.
V počátcích okupace byl nežádoucí např. český hovor na veřejných
prostranstvích. Došlo ke zrušení všech českých spolků. V předvečer
okupace zbytku republiky 14. března 1939 vytloukaly jednotky SA
místním Čechům okna a jinak jim vyhrožovaly. Provozovny českých
živnostníků byly úředně zavírány. Nacisté se snažili na Ústecku
důsledně vykořenit české historické tradice. Jednotky SA důsledně
Čechy střežili při výročích upálení Mistra Jana Husa a výročích
vzniku republiky. V den slunovratu 21. června 1941 padl za oběť
"kulturní očisty" nacistů pomník husitské bitvy Na běhání.
Gestapo ve spolupráci s četnictvem a oddíly Hitlerovy mládeže
pronásledovalo české trampské hnutí.
Rozsáhlá perzekuce proběhla proti ústeckým židům. Části bohatších
židů se podařilo Ústí opustit ještě před nacistickou okupací.
Rodiny Petschků a Weinmannů prodaly pod cenu svůj majetek Živnobance
a emigrovaly do Velké Británie a později USA.
Někteří židé byli zatčeni ještě v říjnových dnech roku 1938 a
vyšetřováni. V polovině listopadu NSDAP organizovala protižidovské
demonstrace, při nichž docházelo k rozbíjení výloh židovských
obchodů. 31. prosince 1938 nacisté vypálili synagogu v Malé hradební.
V základech synagogy zřídila ústecká řeznická firma Houdek "družinný
dům" a výrobnu uzenin. Po válce česká správa města umístila
do základů synagogy veřejné záchodky.
V letech 1941-1942 byl zbytek ústeckých židů internován v táboře
v Krásném Lese. Z Krásného Lesa byli internovaní židé postupně
deportováni do vyhlazovacích táborů na území Polska.